מכל מלמדײ השכלתי (duchifat) wrote,
מכל מלמדײ השכלתי
duchifat

Принцип Злотовласки и трех медведей

Обнаружил, что наш обзор об энтропии Вороного (https://www.mdpi.com/1099-4300/20/12/956) цитируют вот в этой статье на Биорхиве (интересно, где она выйдет?):


Yun-Tao Liu, Chang-Lu Tao, Xiaokang Zhang, Lei Qi, Rong Sun, Pak-Ming Lau, Z. Hong Zhou, Guo-Qiang Bi "Mesophasic organization of GABAA receptors in hippocampal inhibitory synapse" doi: https://doi.org/10.1101/2020.01.06.895425

"...We found that these receptors are organized hierarchically: from GABAAR super-complexes with a fixed 11-nm inter-receptor distance but variable relative angles, through semi-ordered two-dimensional receptor networks with reduced Voronoi entropy, to mesophasic assembly with a sharp phase boundary. This assembly aligns with condensates of postsynaptic scaffolding proteins and putative presynaptic vesicle release sites. Such mesophasic self-organization may allow synapses to achieve a “Goldilocks” state with a delicate balance between stability and flexibility, enabling both reliability and plasticity in information processing...

Intriguingly, the mean size of receptor networks in a synapse, when plotted against receptor concentration, was always larger than that for simulated randomly distributed receptors (RDR) or randomly distributed receptors without overlap (RDR*) (Fig. 3d).Furthermore, the overall distribution of network size followed power law (Fig. 3e; Extended Data Fig. 6b). The power-law exponent (1.87), representing the fractural dimension of receptor networks, was smaller than that for RDR (2.44) and RDR* (2.40) (Fig. 3e). These results suggest that receptor networks tend to “attract” more receptors to grow into larger networks, a property typically found in self-organizing processes near critical states.

To quantify the degree of orderliness for the receptor organization, we calculated Voronoi entropy that measures information content in the Voronoi tessellation of the receptor localizations....."
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.06.895425v1.abstract

Я когда-то увлекался SOC (само-организующейся критичностью) при трении, потом забросил это. В свое время обратил внимание на то, что мою статью в Скрипта Материалии про супергидрофобию и SOC https://doi.org/10.1016/j.scriptamat.2008.06.013 (это была opinion статья, без результатов) процитировал биофизик, который занимается сверткой протеинов, мол, авторы не в курсе что SOC - основная характеристика свертывания белков, ведомая гидрофобными взаимодействиями (https://doi.org/10.2174/092986612802762741).

Я вообще интересуюсь сверткой белков, с философской точки зрения, потому что мне кажется, что это вот тот процесс, который превращает текст (последовательность символов) в материальное (вторичную-третичную-четвертичную структуру белка). Но SOC мне кажется в целом забавной, но переоцененной темой, как вообще фракталы в физике (да и прочие околокритические явления).

А вот похоже, что в этих нейро-науках SOC отнюдь не вышла из моды. Принцип Злотовласки [и трех медведей], ага? https://en.wikipedia.org/wiki/Goldilocks_principle
Tags: science
Subscribe

  • (no subject)

    На здешних латинских танцевальных вечеринках не хватает партнерш. Мне, по крайней мере. Среди латиносов больше мужиков. Причем не то, чтобы девушек…

  • (no subject)

    Хотел написать про сальсу, но неожиданно отвлекся на фейсбук, который почему то решил, что мой аккаунт стал подозрителен и удалил его.

  • (no subject)

    Если в офис стучится кто-то, рассуждающий про то, что у меня недостаточно грантов, нужно его встречать приветствием: - Деньги принес? - ...??? - Ну,…

  • Post a new comment

    Error

    Comments allowed for friends only

    Anonymous comments are disabled in this journal

    default userpic

    Your reply will be screened

    Your IP address will be recorded 

  • 16 comments

  • (no subject)

    На здешних латинских танцевальных вечеринках не хватает партнерш. Мне, по крайней мере. Среди латиносов больше мужиков. Причем не то, чтобы девушек…

  • (no subject)

    Хотел написать про сальсу, но неожиданно отвлекся на фейсбук, который почему то решил, что мой аккаунт стал подозрителен и удалил его.

  • (no subject)

    Если в офис стучится кто-то, рассуждающий про то, что у меня недостаточно грантов, нужно его встречать приветствием: - Деньги принес? - ...??? - Ну,…